Все оказалось очень просто. Нажмите ПКМ по ярлыку (если ярлыка нет, сделайте его) лаунчера Майнкрафта, выберите пункт "Свойства".  В графе "Ярлык" найдите пункт "Объект:". В нем пишется место расположения exe файла лаунчера.
Так "Объект:" выглядит у меня:
"D:\Games\Minecraft\MinecraftLauncher.exe"

После адреса, через пробел добавьте "--workDir (полный путь к папке)".

Так это выглядит у меня:
"D:\Games\Minecraft\MinecraftLauncher.exe --workDir D:\Games\Minecraft\.minecraft"

Здесь "D:\Games\Minecraft\" адрес по которому будет создаваться папка ".minecraft", вместо "\AppData\Roaming".

Если укажите в качестве адреса просто "D:/", то всё содержимое папки ".minecraft" завалит корень диска.

Чтобы перенести уже установленный майнкрафт, идем в "\AppData\Roaming", вырезаем папку ".minecraft", вставляем в "нужное место". Допустим, переносим папку на диск D, а лаунчер надодится по адресу "C:\Games\Minecraft\Minecraft.exe", тогда "Объект:" должен выглядеть так:
"C:\Games\Minecraft\Minecraft.exe --workDir D:\.minecraft".
Результат: все новые миры и все файлы игры теперь будут на диске D в стандартной папке ".minecraft".